托林寺位于阿里地区札达县,始建于公元996年,此时中原为宋太宗至道二年。
在吐蕃末代赞普朗达玛(838-842年在位)灭佛后,阿里古格王朝在托林寺举行法会,此后藏传佛教兴盛。也就是说,托林寺在藏传佛教由被灭到兴盛的转折中具有重要意义。
之后的17世纪30年代,古格王朝被拉达克王国(现位于印控克什米尔)灭亡,阿里地区被拉达克统治半个世纪。拉达克王国信仰噶举派,在此期间作为格鲁派寺院的托林寺遭到破坏。
之后的1679年起,和硕特蒙古的西藏政权通过多年的征战收复阿里,拉达克王国退回原境内,托林寺再次成为格鲁派的寺院。
托林寺在WG中遭到严重破坏,大殿由于被当作粮仓,从而大殿及大殿内的壁画得以幸存。
托林寺1996年列入第四批全国重点文物保护单位。